Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 358658 358661 4 120 [0] [0] 123 sfmC pilin chaperone, periplasmic

Only 100 of 120 total aligned reads displayed.

CAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCC  >  minE/358597‑358657
                                                            |
cAGCCAGAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:825406/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCAGCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1388175/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:316367/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:50368/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:485886/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:479389/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:461677/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:425793/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:425033/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:414999/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:391092/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:390846/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:390646/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:332365/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:513776/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:31389/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:298542/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:28526/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1864143/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1839962/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1809668/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1770487/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1761858/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1001137/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1733699/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:695930/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:969306/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:960486/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:955232/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:947631/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:943108/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:871444/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:853762/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:84014/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:772328/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:73755/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:704841/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1759759/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:686204/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:63406/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:625574/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:621383/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:614364/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:608892/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:605624/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:551556/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:544702/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:519745/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1198612/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1730980/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1391123/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1331993/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1266723/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1254064/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1249026/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1240226/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1231391/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1223384/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1218306/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1209647/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1203788/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1399180/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:118810/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1171149/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1160952/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1148273/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1102685/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1081517/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1066313/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:106514/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1049317/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1038293/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1007502/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1005352/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1548186/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1711075/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1685504/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1671056/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1648743/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1646936/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:163751/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1621667/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1612894/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1554265/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1419543/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1530738/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1517178/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1512152/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1507751/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1477641/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1476189/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1473256/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1427067/61‑1 (MQ=255)
cAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1424804/61‑1 (MQ=255)
 aGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:352132/60‑1 (MQ=255)
 aGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:381579/60‑1 (MQ=255)
 aGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:220434/60‑1 (MQ=255)
 aGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:1364284/60‑1 (MQ=255)
   ccAAAAGTTGGTGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccc  <  1:272665/58‑1 (MQ=255)
               gAATGCTATGTCTGCACCCAGAGTTAAATCACAAATTCCCTTAccc  <  1:216631/46‑1 (MQ=255)
                                                            |
CAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCC  >  minE/358597‑358657

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑