Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	444151	444261	111	46 [0]	[0] 12	speF/kdpE	ornithine decarboxylase isozyme, inducible/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with KdpD

CTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGA  >  minE/444089‑444150                                                              | tttATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:886715/2‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGTCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:315335/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:487684/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:187531/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1898841/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:207752/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:211561/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:237159/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:299215/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:333253/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:406446/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:458578/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:482736/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:185487/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:652911/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:770837/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:797191/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:802489/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:832324/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:833953/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:838657/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:860175/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:90268/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1411994/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1129838/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1142122/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1205945/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1249323/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1258645/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:128462/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1290098/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1321042/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1333606/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1349672/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:136353/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1102575/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1460048/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1479354/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:152187/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1583277/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1598306/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1673041/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1681964/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1773105/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1818710/1‑62 (MQ=255) cTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGtgaatga  >  1:1827241/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGA  >  minE/444089‑444150

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑