Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	446579	446582	4	72 [0]	[0] 27	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

TGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTGCG  >  minE/446517‑446578                                                              | tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGATCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1061662/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:247359/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:541243/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:518901/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:388366/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:375404/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:321403/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:307810/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:306064/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:257625/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:587604/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:212476/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:203993/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:189454/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1876460/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1872682/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:186333/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:563922/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1018180/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:600529/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:628184/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:633645/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:635911/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:637136/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:652186/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:654053/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:791388/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:82125/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:826262/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:869371/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:873589/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:904216/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:915031/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1179643/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:140243/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:139548/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1353041/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:134865/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1289776/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1277073/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:124125/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1237421/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1834336/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1164762/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:116186/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1147043/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1092277/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1086051/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1074438/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1011748/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1405383/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:167489/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1814471/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:164015/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:162873/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1615254/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1842962/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1517354/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1507267/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1505517/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1483640/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1463638/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1415305/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGGgcg  <  1:289664/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGAACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1069798/62‑1 (MQ=255) tGAATTTGAACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:371405/62‑1 (MQ=255)  gAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:944785/61‑1 (MQ=255)  gAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:827009/61‑1 (MQ=255)  gAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:1581548/61‑1 (MQ=255)      ttGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:873613/57‑1 (MQ=255)        gTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTgcg  <  1:44021/55‑1 (MQ=255)         tACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTCTCCGGCGCGTTGTTAATCGGgcg  <  1:806465/54‑1 (MQ=255)                                                              | TGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTTAAAAGAGCGGTTATCCGGCGCGTTGTTAATCGTGCG  >  minE/446517‑446578

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑