Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	446645	446888	244	27 [0]	[0] 32	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

GGTGGTTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTC  >  minE/446583‑446644                                                              | ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:477026/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:987209/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:986883/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:967127/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:845338/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:844561/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:740191/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:652545/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:631760/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:63025/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:620207/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:605032/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:530291/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:508046/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:1305816/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:458704/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:439979/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:426988/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:368738/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:366594/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:1715686/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:1705222/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:1694963/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:1668828/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:1503666/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:1469712/1‑62 (MQ=255) ggtggtTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTc  >  1:1317934/1‑62 (MQ=255)                                                              | GGTGGTTCATCAAGCGCGACCAGCACCTGATCGAGATCGGGGGCGATGCGCGCCAGTCGGTC  >  minE/446583‑446644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑