Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	479373	479449	77	22 [0]	[0] 43	cydA	cytochrome d terminal oxidase, subunit I

CGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGT  >  minE/479313‑479372                                                            | cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTTCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:518098/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1523388/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:906112/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:718208/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:588862/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:405068/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:346855/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:206016/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1884115/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1831753/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1777103/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1204474/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1412314/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1353443/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1299065/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1291823/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1279730/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1256126/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1243341/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1242538/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1239530/1‑60 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCtggt  >  1:1204720/1‑60 (MQ=255)                                                            | CGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGT  >  minE/479313‑479372

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑