Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	544038	544192	155	34 [0]	[0] 194	[mntR]	[mntR]

GCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAACTCT  >  minE/544003‑544037                                   | gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:647692/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:248924/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:260736/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:342795/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:425795/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:463314/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:484154/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:548744/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:565874/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:188529/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:65870/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:78134/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:789078/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:820517/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:845596/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:99562/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:999407/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1710575/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1073218/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1105799/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1159544/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1168704/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1334716/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1427228/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1482699/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1582735/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1042478/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1741660/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1789950/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1797503/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1831494/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1839905/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1847780/35‑1 (MQ=255) gCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAActct  <  1:1857146/35‑1 (MQ=255)                                   | GCTAAAACGTTAATTTTTTGTACCTTCGCAACTCT  >  minE/544003‑544037

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑