Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	32058	32154	97	77 [0]	[0] 2	caiF	DNA‑binding transcriptional activator

AAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGC  >  minE/31998‑32057                                                            | aaatCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:551500/1‑60 (MQ=255) aaatCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1370852/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:286524/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:592676/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:549369/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:515688/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:461123/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:35768/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:354387/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:351060/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:616077/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:283917/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:248334/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:24211/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:210741/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1890591/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:186579/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1806129/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1776191/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1762836/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:774573/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:998878/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:987940/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:939752/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:93485/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:922171/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:920490/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:916139/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:91414/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:88039/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:612295/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:770296/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:732603/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:70521/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:677277/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:650682/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:62664/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:618465/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:175445/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1222238/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1382884/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1378069/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1372293/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:133057/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1327190/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1321153/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:126623/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1255097/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1226950/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1410789/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1212665/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1210941/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:117222/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1159082/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1140617/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:111815/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:106896/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1047820/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1549279/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1749846/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1743873/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1718945/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1648671/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1635149/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1632647/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1622113/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1587683/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:104550/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1538342/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1518071/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1509498/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1509128/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1476238/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1472144/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1471638/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  >  1:1471630/1‑60 (MQ=255) aaaaCCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTAATAGc  >  1:1840477/1‑60 (MQ=255)                                                            | AAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGC  >  minE/31998‑32057

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑