Missing coverage evidence...
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CAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACA  >  minE/572248‑572310                                                               | cAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTT‑CGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1884101/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAGCCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1616269/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTTGATCACCAACa  <  1:73321/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:629677/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:883403/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:255840/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:260905/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:278405/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:309241/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:321066/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:345512/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:417813/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:425149/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:58117/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:883297/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1162478/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:647328/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:661299/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:745003/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:789109/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:790180/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:873044/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:873203/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1860730/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1138239/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1165475/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1174302/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:12061/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1217651/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1304842/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1368090/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:141884/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1423328/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1638920/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1647119/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1680600/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1723895/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1746574/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1748826/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1763001/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1766151/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1771055/62‑1 (MQ=255)  aaTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:253632/62‑1 (MQ=255)      gCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:1342033/58‑1 (MQ=255)                cAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACa  <  1:967642/48‑1 (MQ=255)                                                               | CAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACA  >  minE/572248‑572310

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑