Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 655226 655824 599 78 [0] [0] 26 ycbR predicted periplasmic pilin chaperone

CATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAA  >  minE/655165‑655225
                                                            |
cttatTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:25334/59‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACATAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1072978/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:480297/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:679607/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:674342/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:658208/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:649328/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:631998/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:589923/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:587204/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:579999/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:548493/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:491119/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:700675/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:433496/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:387690/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:387325/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:361678/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:346505/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:34255/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:341749/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:843056/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:927323/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:906090/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:895467/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:874951/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:866413/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:864685/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:855915/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:854654/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:847670/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1005521/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:83791/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:797467/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:78986/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:734878/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:729853/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:724328/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:722340/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:719040/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1259705/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1535841/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1532227/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1516002/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1471098/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1443963/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1369721/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1350093/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:133277/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1326465/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:209138/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1242818/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1192420/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:117672/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1111759/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1094687/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1094490/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1042770/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1012779/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1556567/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:193290/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1899174/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1852028/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1836985/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1817330/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1808689/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1730274/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1728089/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1715112/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1695365/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1625168/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1606171/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1597542/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1566822/61‑1 (MQ=255)
cATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1540106/61‑1 (MQ=255)
 atatTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:414905/60‑1 (MQ=255)
 atatTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:275063/60‑1 (MQ=255)
 atatTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa  <  1:1003307/60‑1 (MQ=255)
                                                            |
CATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAA  >  minE/655165‑655225

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: