Missing coverage evidence...
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TGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATCAACA  >  minE/743226‑743287                                                              | tGGCTGCTGTTGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATcaaca  >  1:1807326/1‑62 (MQ=255) tGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAATCCGGCGATcaaca  >  1:1426752/1‑62 (MQ=255) tGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATcaaca  >  1:410440/1‑62 (MQ=255) tGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATcaaca  >  1:555977/1‑62 (MQ=255) tGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATcaaca  >  1:553167/1‑62 (MQ=255) tGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATcaaca  >  1:551902/1‑62 (MQ=255) tGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATcaaca  >  1:524419/1‑62 (MQ=255) tGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATcaaca  >  1:49655/1‑62 (MQ=255) tGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATcaaca  >  1:488317/1‑62 (MQ=255) 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TGGCTGCTGATGCTCAAAGCAGGGTGGTTTGAGTACCGCTGGCGACAAACCGGCGATCAACA  >  minE/743226‑743287

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑