Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	861454	861645	192	49 [0]	[0] 20	trpE	component I of anthranilate synthase

TTCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGAA  >  minE/861400‑861453                                                      | ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTGAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:43836/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCTCAAGGTCATAAGAGaa  <  1:776879/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:641606/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:272112/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:332183/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:395059/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:39800/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:404088/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:448638/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:465871/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:55148/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:564597/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:60759/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:247440/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:729475/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:751395/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:781470/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:860306/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:905376/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:928423/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:941976/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:956181/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:96061/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:972220/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:155733/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1042187/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1045567/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1088932/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1213596/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1214497/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1237051/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1247687/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1343832/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1378771/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1007664/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1561128/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1580553/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:159370/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:161524/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1658829/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1715410/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1725958/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1735762/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1817899/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1892200/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:210291/54‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACAGTTCCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:123601/54‑1 (MQ=255)  tCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:918641/53‑1 (MQ=255)          cAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGaa  <  1:1247101/45‑1 (MQ=255)                                                      | TTCCGCTGACAGTTGCGGTAAATCTTCAAATCCCGCCACAAGGTCATAAGAGAA  >  minE/861400‑861453

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑