Missing coverage evidence...
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GGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGA  >  minE/896153‑896213                                                             | ggCCGTTTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:395842/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1774774/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1766619/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1871090/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:953064/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:94917/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:235319/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:246700/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:279568/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:286680/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:940638/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:917214/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:491486/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:570926/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:586781/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:606750/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:609482/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:615816/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:897702/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1445284/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1041964/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1149170/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1185907/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1275823/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1279543/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:132770/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1358624/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:141621/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1447145/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1524862/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:988534/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:97981/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:161563/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1625207/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:163692/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1716300/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGATCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1071358/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGAGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:190593/61‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGGGTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1564907/61‑1 (MQ=255)                   tGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:204175/43‑1 (MQ=255)                   tGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:977326/43‑1 (MQ=255)                    gAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:401722/42‑1 (MQ=255)                        aGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:1567195/38‑1 (MQ=255)                        aGGTGACGGCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGa  <  1:361077/38‑1 (MQ=255)                                                             | GGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGA  >  minE/896153‑896213

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑