Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	897183	897305	123	99 [0]	[0] 38	pspF	DNA‑binding transcriptional activator

ATCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTC  >  minE/897121‑897182                                                              | aTCGCTTGTGCCGTGGCGATTCACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:891270/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACTAATATTTc  <  1:1421869/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:399648/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:587205/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:579422/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:5216/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:518082/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:517207/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:509669/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:500481/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:464936/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:419949/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:407746/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:678621/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:394859/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:383066/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:372164/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:351137/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:303000/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:299585/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:284450/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:269297/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:214417/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:206036/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:84921/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:977854/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:959230/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:944788/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:944673/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:923735/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:903536/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:903106/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:876086/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:864923/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:857677/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1053870/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:803219/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:801733/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:785431/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:780352/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:778540/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:747779/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:717096/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:714124/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:700564/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:691137/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1187513/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1392653/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1384810/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1350560/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1305549/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1302294/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:126644/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1264653/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1248268/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1247670/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1234125/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1232992/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1208073/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1387720/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1183965/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1174866/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1162233/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:116160/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:114550/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:112090/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1088354/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1084523/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1070225/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1054622/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:101360/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1558928/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1674673/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1722363/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1637283/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1591986/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1584794/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1563357/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1724302/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1562978/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1726173/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1752264/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1553474/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1778197/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1512208/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1498873/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1487814/62‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1474427/62‑1 (MQ=255)  tCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1830893/61‑1 (MQ=255)  tCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:936289/61‑1 (MQ=255)  tCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:363244/61‑1 (MQ=255)  tCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:427511/61‑1 (MQ=255)  tCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1869216/61‑1 (MQ=255)   cGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:460428/60‑1 (MQ=255)       ggTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:324472/56‑1 (MQ=255)          gCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:1238715/53‑1 (MQ=255)           ccGTGGCGTTACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:253654/52‑1 (MQ=255)                gCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:791838/47‑1 (MQ=255)                  gATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTc  <  1:488934/45‑1 (MQ=255)                                                              | ATCGCTGGTGCCGTGGCGATACACTGAACGTTCCACCACGTTTTTCAATTCACGAATATTTC  >  minE/897121‑897182

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑