Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	941325	941351	27	77 [0]	[0] 46	bdm	biofilm‑dependent modulation protein

TCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCA  >  minE/941263‑941324                                                              | tCAGCTCCATGAGAATGTCATGTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:146082/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCGGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1232137/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATTCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1447079/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:399133/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:65345/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:634223/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:569883/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:564827/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:527185/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:519893/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:463695/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:439936/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:657711/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:39654/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:375205/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:354360/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:338457/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:320711/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:280386/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:2622/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:247585/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:83513/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:985376/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:985038/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:977214/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:96537/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:904898/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:892549/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:876109/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:85865/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:848015/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1895867/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:803996/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:781018/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:756431/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:756292/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:745477/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:719215/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:710659/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:675116/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1276697/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:215038/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1436557/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1416784/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1414945/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1391512/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1359446/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1357161/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1356670/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1446769/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1276658/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1242244/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:117564/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1142535/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1110039/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1043158/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1024867/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1558694/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:213558/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1024484/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1889819/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1871947/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1871136/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1840441/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1837011/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1724583/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1704817/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1699748/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:169686/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1667402/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1666285/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1657169/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1594355/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1513538/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATCCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1303507/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATGAGAATGTCATCGTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCa  >  1:1287584/1‑62 (MQ=255) tCAGCTCCATAAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCAGTGCCCGAAGGCCTTGcaca  >  1:1111191/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCA  >  minE/941263‑941324

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑