Missing coverage evidence...
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GATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATC  >  minE/959645‑959706                                                              | gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:625733/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1117428/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1883365/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:227021/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:277198/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:351144/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:356133/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:363828/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:402878/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:537434/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:541307/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:545880/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1852273/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:636481/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:6385/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:701067/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:70270/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:78111/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:803881/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:812393/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:948815/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:955713/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:996620/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:998666/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1354732/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1143978/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1182921/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1190128/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1213439/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1225604/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1236950/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1259051/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:125917/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1280061/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1327887/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1845870/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1411017/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1447044/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1481851/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1565662/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1566691/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1585902/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1709488/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1738333/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1753488/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:1765480/62‑1 (MQ=255) gATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:182151/62‑1 (MQ=255)  aTACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATc  <  1:6927/61‑1 (MQ=255)                                                              | GATACCAGCGTTGATAAAATTGGCGCAATTGTGCCGGTGTGACCGTGGCGACAGTATCCATC  >  minE/959645‑959706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑