Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	993521	993590	70	46 [0]	[0] 28	clcB	predicted voltage‑gated chloride channel

GCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGA  >  minE/993459‑993520                                                              | gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:503203/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1002798/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1825185/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1834518/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:271064/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:295106/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:351551/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:362408/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:424197/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:434504/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:486550/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1764266/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:582160/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:582887/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:614780/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:698690/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:700228/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:745079/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:784916/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:819890/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:898811/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1330658/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1005855/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1008851/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1015868/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:110228/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1126181/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1239581/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1259017/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1260241/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1308827/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1738571/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1337726/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1413295/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1438678/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1508365/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1530514/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1669681/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:167247/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1714209/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGAAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:853823/62‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCGATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1649202/62‑1 (MQ=255)  ccGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTTGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:818055/61‑1 (MQ=255)  ccGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1242241/61‑1 (MQ=255)             aTGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1757989/50‑1 (MQ=255)                   gCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGa  <  1:1827433/44‑1 (MQ=255)                                                              | GCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGA  >  minE/993459‑993520

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑