Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1010707 1010707 1 88 [0] [0] 77 rstB sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with RstA

CTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAG  >  minE/1010645‑1010706
                                                             |
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCTCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1524208/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATTAACAg  <  1:1578892/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:278104/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:434498/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:413873/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:352282/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:341410/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:326699/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:326549/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:297830/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:292988/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:486369/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:276893/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:265582/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:250485/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:248773/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:231817/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:214704/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:202184/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:200609/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:100843/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:767340/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:965647/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:958073/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:955664/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:938332/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:928808/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:921793/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:871247/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:869431/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:865767/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:820452/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1899418/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:729318/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:696537/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:676180/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:617908/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:602611/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:580840/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:570261/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:525159/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:498094/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1285281/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1478783/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1450543/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1085126/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1114163/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1416155/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:139716/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:139320/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1342020/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1304862/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1488932/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1144384/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1273911/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1273404/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1267992/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:125752/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1213882/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1203503/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1177786/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:117502/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1024821/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:185630/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1850829/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:181829/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:101781/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1810837/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1777536/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1776704/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1710349/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1694572/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1045110/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1595090/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1083569/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:158212/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1563536/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1537529/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1512277/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGAGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:322975/62‑1 (MQ=255)
cTGGGGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1877959/62‑1 (MQ=255)
 tGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1425696/61‑1 (MQ=255)
 tGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:254869/61‑1 (MQ=255)
    tgtTCAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGGTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:201101/58‑1 (MQ=39)
          aaTTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1592213/52‑1 (MQ=255)
          aaTTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:1605263/52‑1 (MQ=255)
                ccgccgAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:60327/46‑1 (MQ=255)
                 cgccgAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAg  <  1:470273/45‑1 (MQ=255)
                                                             |
CTGGTGTACAAATTTACCGCCGAACGCGCGGGCAAACAGTCGCTGGATGATTTGATGAACAG  >  minE/1010645‑1010706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: