Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1019628	1019858	231	70 [0]	[0] 4	uidC	predicted outer membrane porin protein

TTCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCCACCAC  >  minE/1019567‑1019627                                                             | ttCCTTCACGGTTTCGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:58328/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCTAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1578711/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:513100/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:611800/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:598302/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:582844/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:579579/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:557486/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:542660/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:627838/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:505450/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:446141/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:416017/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:412625/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:335220/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:333982/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:32316/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1003687/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:780835/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:989198/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:98363/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:981269/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:959247/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:943732/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:913013/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:900611/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:877826/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:321404/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:773840/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:750712/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:709944/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:702028/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:692785/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:689607/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:661882/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1575359/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1057854/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1142995/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1148904/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1173941/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:121129/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1264254/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1292692/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1428122/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1480845/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1518585/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:153205/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1545428/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1571778/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1611262/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1845510/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:303415/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:30072/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:287573/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:187257/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1857015/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1625969/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1749901/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1713129/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:170488/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1691930/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1680534/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCaaccac  <  1:734252/61‑1 (MQ=255) ttCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGAAAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:158740/61‑1 (MQ=255) atCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1269273/60‑1 (MQ=255)  tCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1176208/60‑1 (MQ=255)   ccTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:114781/59‑1 (MQ=255)               cGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:315709/47‑1 (MQ=255)                gATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:438134/46‑1 (MQ=255)                      gACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCcaccac  <  1:1818015/40‑1 (MQ=255)                                                             | TTCCTTCACGGTTACGATCAAGACTTAATGAAAAGGGATAGCCAATGTCGGTATCCACCAC  >  minE/1019567‑1019627

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑