Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1035665	1036254	590	65 [0]	[0] 106	rsxC	fused predicted 4Fe‑4S ferredoxin‑type protein

CCGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTCCC  >  minE/1035627‑1035664                                      | ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGTATGTccc  <  1:272367/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGTATGTccc  <  1:931611/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:443900/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:645429/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:58460/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:577813/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:538753/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:51640/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:504480/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:496470/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:473455/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:682645/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:340351/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:315402/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:216219/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:213824/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:189198/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1800785/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:699380/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:761327/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:776243/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:786975/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:812981/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:828035/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:864065/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:875202/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:904190/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:934377/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:937170/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:938698/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:971510/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:98068/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1274668/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1351683/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1351378/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1334979/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1321090/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1307086/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1304985/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1301685/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1286010/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1359224/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1265854/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1146946/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1131208/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1126693/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:104929/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1030855/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1025979/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1014442/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1380710/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1392018/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1400626/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1446176/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1489472/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1526657/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1583315/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1602780/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1611525/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1636558/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:173462/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1743431/38‑1 (MQ=255) ccGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGCATGTccc  <  1:1767467/38‑1 (MQ=255)  cGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:435668/37‑1 (MQ=255)   gCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTccc  <  1:1677315/36‑1 (MQ=255)                                      | CCGCTAATGGGCTTTACCTTGCCATGGCTGGATGTCCC  >  minE/1035627‑1035664

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑