Missing coverage evidence...
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AACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGC  >  minE/1071222‑1071284                                                               | aaCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGG‑GGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:977226/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATGCCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:218192/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:22857/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1139239/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:856835/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:854194/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:827189/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:699887/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:620258/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:521098/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:398022/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:345267/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:333474/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:300505/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:299677/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1198666/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1001177/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:194849/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1885307/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1854430/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1781678/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1660148/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1638278/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1544987/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1297311/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1212739/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGGGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:193175/62‑1 (MQ=255)   cTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATggcggc  <  1:1669138/61‑1 (MQ=255)                                                               | AACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGC  >  minE/1071222‑1071284

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑