Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1112481	1113086	606	77 [0]	[0] 3	pps	phosphoenolpyruvate synthase

TTTATTTTATTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCA  >  minE/1112419‑1112480                                                              | tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:372155/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1560847/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1591094/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1645207/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1687234/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1687438/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1702900/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1709818/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1767254/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:192462/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:296690/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:301325/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:323274/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:370001/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1167601/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:430723/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:521658/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:534293/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:555023/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:578144/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:649115/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:69366/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:895358/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:9020/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:950374/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:968562/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:979878/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:983021/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1553068/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1099725/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:118704/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1188779/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1214129/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1226684/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1239670/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1242444/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1246710/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1273474/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:133113/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1335907/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1553904/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1517575/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1445921/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:144292/62‑1 (MQ=255) tttattttatTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1368635/62‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:267509/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:537359/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1256690/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1805695/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:594892/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:644607/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:661080/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:806975/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:828392/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:853728/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1502309/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1548891/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:531014/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:21488/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1294231/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:376020/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:409223/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1336713/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:437062/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:438224/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:487907/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1270726/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1257801/61‑1 (MQ=255)  ttattttattTCTTCAGTTCAGACAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:308395/61‑1 (MQ=255)   tattttatttCTTCAGTTTAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:686228/60‑1 (MQ=255)   tattttatttCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:431539/60‑1 (MQ=255)   tattttatttCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:445001/60‑1 (MQ=255)   tattttatttCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1289622/60‑1 (MQ=255)   tattttatttCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:131984/60‑1 (MQ=255)       ttatttCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:1240614/56‑1 (MQ=255)         atttCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:822510/54‑1 (MQ=255)         atttCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCa  <  1:528012/54‑1 (MQ=255)                                                              | TTTATTTTATTTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCA  >  minE/1112419‑1112480

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑