Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1146399	1146426	28	66 [0]	[0] 35	chbR	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCC  >  minE/1146338‑1146398                                                             | cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAACCTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:110205/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:503074/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:692640/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:670502/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:6606/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:564607/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:556966/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:556017/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:545192/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:516963/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:751883/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:500106/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:47395/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:467709/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:466431/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:428819/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:402630/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:739975/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:340271/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:76670/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:801530/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:817977/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:831491/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:864235/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:871038/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:874689/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:874968/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:894237/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:900645/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:902172/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:946684/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:98225/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:984981/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1587545/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1055095/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1093530/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1127184/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1145262/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1175760/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1208957/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1294242/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1332468/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1339161/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1363460/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1369863/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1389185/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1460648/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1523385/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1554424/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1730121/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:305805/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:2721/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:27104/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1883707/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1859557/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1858260/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1793354/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1765350/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:102169/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1702347/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:166667/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1665661/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1664314/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1659252/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACAGGcc  >  1:612583/1‑61 (MQ=255) cGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACCCGGGCTACTATAACCGGcc  >  1:1429284/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGTAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCC  >  minE/1146338‑1146398

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑