Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1161610	1161662	53	95 [0]	[0] 31	ydjX	predicted inner membrane protein

ATCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAT  >  minE/1161557‑1161609                                                     | aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCCCGACCCTACCCGGTAt  <  1:1065204/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:307800/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:534359/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:489360/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:453765/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:42137/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:407115/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:406689/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:385802/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:350579/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:349185/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:32676/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:32014/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:553245/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:304182/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:29594/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:274177/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:265211/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:264747/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:244193/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:235249/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1006057/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:203183/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:852911/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:99556/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:984658/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:978718/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:971167/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:971018/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:938542/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:931988/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:891412/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:877794/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:86018/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:548335/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:817575/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:815948/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:777260/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:763232/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:698833/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:691519/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:624641/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:58322/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:554479/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:217783/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1167199/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1360530/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1347744/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1710809/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1260319/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1243891/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1194062/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1193923/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1193884/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1185548/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1172360/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1170175/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1314813/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1155396/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1144517/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1131297/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1128051/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1068591/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1057660/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1050643/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1035119/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1019565/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1008363/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1708470/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1664914/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1609129/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1577687/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1565848/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1560061/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1409719/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1548051/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1537253/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1697980/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1520349/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1450148/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1414587/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTAACGACCCTACCCGGTAt  <  1:29613/53‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCT‑GCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:261780/52‑1 (MQ=255)  tCGCGTTCTGGCGTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTTCCCGGTAt  <  1:1692575/52‑1 (MQ=255)  tCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:321041/52‑1 (MQ=255)  tCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:676135/52‑1 (MQ=255)  tCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1167024/52‑1 (MQ=255)  tCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1443450/52‑1 (MQ=255)  tCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1437127/52‑1 (MQ=255)  tCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1077562/52‑1 (MQ=255)   cGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:793623/51‑1 (MQ=255)   cGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:162605/51‑1 (MQ=255)      cTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1536031/48‑1 (MQ=255)             ccTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:718852/41‑1 (MQ=255)             ccTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAt  <  1:1411207/41‑1 (MQ=255)                                                     | ATCGCCTTCTGGCCTTATACCCTTATTTCGGCACTCACGACCCTACCCGGTAT  >  minE/1161557‑1161609

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑