Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1164051	1164155	105	87 [0]	[1] 98	ynjB	conserved hypothetical protein

GCGGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCT  >  minE/1163989‑1164050                                                              | gcggcgAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:303807/62‑1 (MQ=255) gcgGTTAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1867952/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCTTTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:493725/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:467107/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:482921/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:435979/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:434533/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:407697/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:381403/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:35500/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:343983/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:322878/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:321313/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:301308/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:27169/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:27165/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:260288/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1871354/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1851368/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1846693/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1824245/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:796173/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:915396/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:915029/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:914959/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:907619/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:874123/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:861205/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:846455/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:835784/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:815124/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:470376/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:769423/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:735358/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:732991/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:727660/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:63208/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:511444/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:505833/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:48931/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1052719/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1248156/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1456436/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1421418/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1378937/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:136472/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1363331/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1336962/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1323330/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1292455/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1822635/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1222282/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:119219/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1178712/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1154514/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1140289/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1098094/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1088538/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:104492/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1790104/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:17086/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1708402/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1723068/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1643095/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1633822/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1756166/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1611676/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1583613/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1559534/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1817742/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1543574/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:18238/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1498793/62‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1468796/62‑1 (MQ=255)  cgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1464660/61‑1 (MQ=255)  cgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:855800/61‑1 (MQ=255)  cgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1712460/61‑1 (MQ=255)  cgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1272194/61‑1 (MQ=255)  cgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1289003/61‑1 (MQ=255)  cgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1362719/61‑1 (MQ=255)  cgGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1448320/61‑1 (MQ=255)   ggTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:940543/60‑1 (MQ=255)          cgcATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:253490/53‑1 (MQ=255)             aTTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:854249/50‑1 (MQ=255)                       aaGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:379282/40‑1 (MQ=255)                         gCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:691018/38‑1 (MQ=255)                          ccGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCt  <  1:1144068/37‑1 (MQ=255)                                                              | GCGGTGAAGCGCATTCAGACCGAAGCCGCAGCCGGACGTAAAACGGGCGGCTCGGTGGATCT  >  minE/1163989‑1164050

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑