Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1167155	1167213	59	83 [0]	[0] 6	[ynjE]	[ynjE]

CAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGATTT  >  minE/1167119‑1167154                                    | cAGAATGGCGCACTCAAGACTACAATGTCGGGAttt  <  1:786225/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAATCTACAATGTCGGGAttt  <  1:1829606/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATTTCGGGAttt  <  1:467667/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:596481/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:599979/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:570922/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:565696/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:560625/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:551788/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:549339/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:460756/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:430008/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:409183/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:373405/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:336091/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:326450/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:314473/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:276522/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:272628/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:247197/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:23136/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1886958/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:774852/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1015194/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:967667/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:923582/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:853807/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:851498/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:846482/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:807410/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:780229/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:779560/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:987601/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:739393/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:717402/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:704918/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:669926/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:668027/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:639144/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:627221/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:615562/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:612971/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1264571/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:141421/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1404534/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1390029/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1350878/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1347517/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1317961/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1304086/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1298026/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1289791/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1448120/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1241443/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1193868/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1147856/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1139853/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1109703/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1103256/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1084326/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:107690/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1018013/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1462708/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1828161/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:180849/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1769493/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1704525/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1679904/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1642840/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1635849/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1593542/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1591158/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1587946/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1575386/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1574065/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:156650/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1562971/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1562211/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1532507/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:15059/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1489087/36‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1866785/36‑1 (MQ=255)  aGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGAttt  <  1:1272808/35‑1 (MQ=255)                                    | CAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTCGGGATTT  >  minE/1167119‑1167154

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑