Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1177142 1177663 522 130 [0] [0] 12 sppA protease IV

Only 100 of 130 total aligned reads displayed.

GCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGT  >  minE/1177103‑1177141
                                      |
tcTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:353028/38‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGGTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:289309/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGTAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:897493/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:260010/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:460906/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:460348/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:42078/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:40464/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:377562/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:349763/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:334010/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:296680/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:286913/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:285594/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:47599/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:251271/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:24367/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:220772/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:204690/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:204116/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:199589/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:193409/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:191398/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1009105/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1877678/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:702229/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:974860/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:959541/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:95653/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:900195/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:898938/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:856957/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:839532/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:829095/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:749870/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:741383/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:706994/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:473693/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:683150/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:666924/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:661475/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:654793/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:636927/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:624842/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:60350/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:581269/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:516965/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:516177/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1893805/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1264993/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1519722/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1876600/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1467410/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:146373/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1463319/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1385/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1383155/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1366455/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1347924/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1297511/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1287421/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:146989/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:12331/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1212421/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1193922/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1167707/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1156250/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1129351/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1125201/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1123096/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1080413/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1061684/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1048381/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:174281/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1857383/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1840695/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1810913/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1809225/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1800889/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1793673/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1788950/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1778595/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1767815/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1758382/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1746483/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1523454/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1726577/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1726036/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1699527/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1681535/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1665573/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1663163/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1619480/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1573945/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1568702/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:1560004/39‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCAACCATGTGTTCCGCGt  <  1:1329590/39‑1 (MQ=255)
 cTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:767350/38‑1 (MQ=255)
 cTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:85864/38‑1 (MQ=255)
 cTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGt  <  1:606489/38‑1 (MQ=255)
                                      |
GCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGT  >  minE/1177103‑1177141

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑