Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1230849	1230962	114	61 [0]	[0] 13	ptrB	protease II

GATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGTT  >  minE/1230789‑1230848                                                            | gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTTCAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:134308/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGCGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1772584/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTGATCGGtt  >  1:1854940/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:646694/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1771179/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1834991/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1897554/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:240300/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:264202/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:284797/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:300016/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:318948/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:331031/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:404163/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:500476/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:604465/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:60956/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1757039/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:657207/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:658313/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:674871/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:690837/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:718012/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:7634/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:783654/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:787413/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:809511/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:874623/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:89840/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:936575/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:956024/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1484485/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1039312/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1074526/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1078311/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1166254/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:118484/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:119231/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1229399/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1263529/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1298223/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1324196/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1346956/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1392711/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1393615/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1435142/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1768379/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1488314/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1505674/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1532753/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:155480/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1574616/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1589166/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1604296/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1606808/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1610993/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1659929/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1665887/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1698360/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1721251/1‑60 (MQ=255) gATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGtt  >  1:1016514/1‑60 (MQ=255)                                                            | GATTTACCGCCATGGCCTGAGTCCATGTCGGTACAGAGCAATAAAAGATGGTCATCGGTT  >  minE/1230789‑1230848

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑