Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1242478	1242562	85	57 [0]	[0] 9	pykA	pyruvate kinase II

CAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAG  >  minE/1242417‑1242477                                                             | cAGATGATGGAGTCAATGATTACTACCCCGATGCCGCCGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:529547/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTACCCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:833340/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:600393/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:208689/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:222397/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:313203/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:341193/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:358759/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:369079/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:410428/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:428045/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:451453/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:503800/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:561379/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:567771/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1016721/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:628730/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:662549/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:697424/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:698440/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:747012/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:75706/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:795525/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:805910/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:818843/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:82453/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:838900/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:849396/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1427230/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1016149/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1069318/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1103317/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1106686/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1136084/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1161061/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1179144/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1197308/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1323845/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1349332/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1375973/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1396461/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1892607/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:14452/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1450917/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1457626/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1532554/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1532576/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1589776/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1745867/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1819150/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1824162/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1854479/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1869841/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1889429/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACCTAg  >  1:1427220/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCACAAGTCATGGACGTAg  >  1:946444/1‑61 (MQ=255) cAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCAGACGAGTGCAGAAGTCATGGACGTAg  >  1:1048488/1‑61 (MQ=255)                                                             | CAGATGATGGAGTCAATGATTACTAACCCGATGCCGACGCGTGCAGAAGTCATGGACGTAG  >  minE/1242417‑1242477

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑