Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1286678	1286726	49	83 [0]	[0] 51	yeeL/shiA	ECK1975:JW1961+JW5325:b4497; hypothetical protein/shikimate transporter

TCTCAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAATGCAATGCA  >  minE/1286616‑1286677                                                              | tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:484500/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:621440/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:606046/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:599074/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:545289/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:532622/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:519399/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:513288/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:510438/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:505136/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:492423/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:65324/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:479324/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:449901/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:432952/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:429505/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:422184/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:401849/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:379848/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:377574/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:257290/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:803285/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:999362/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:98047/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:969456/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:923427/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:909846/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:903903/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:884057/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:816918/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:811463/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:248097/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:802164/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:776643/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:749140/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:729267/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:699518/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:69625/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:689002/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:688596/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:670003/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1277688/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1002374/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1427593/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1424514/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1413026/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1380337/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1353393/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1352254/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1321912/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1320708/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1298347/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1432626/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1240257/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1239862/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1238062/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1202204/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:116308/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1079373/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:107277/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1019211/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1018687/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:169980/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1861750/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:185812/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1811409/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1809722/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1802481/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1788785/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:172948/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1724540/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1711028/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1497681/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1641394/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1637705/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1598363/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1596159/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1586885/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1560976/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1541854/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:1502782/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTCGTTATAatgcaatgca  >  1:1549900/1‑62 (MQ=255) tctcAACAATGATGCTAAAAACATAACTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAatgcaatgca  >  1:860112/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCTCAACAATGATGCTAAAAACATACCTAACCTCGCCTCCCTACTGGTTATAATGCAATGCA  >  minE/1286616‑1286677

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑