Missing coverage evidence...
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CCATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCGT  >  minE/1312591‑1312652                                                              | ccATATAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1470666/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCGGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1603821/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:297701/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:93313/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:811474/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:73824/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:66556/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:616746/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:481606/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:475086/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:470315/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:467158/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:446315/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:423469/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:410524/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:34921/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1032251/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:227865/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:208498/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1817635/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1795388/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1784707/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1705946/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1531805/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1439608/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:121283/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1191828/62‑1 (MQ=255) ccATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:1069492/62‑1 (MQ=255)  cATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCgt  <  1:86115/61‑1 (MQ=255)                                                              | CCATAGAAACACTGGCCGCCGCCGAGCGCCTGACCGCCCACAAAAATGCCGTTACTTTGCGT  >  minE/1312591‑1312652

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑