Missing coverage evidence...
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GCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCG  >  minE/1366558‑1366617                                                            | gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTGTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCg  <  1:678175/60‑1 (MQ=255) gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACTTCATTCACCg  <  1:802844/60‑1 (MQ=255) gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCg  <  1:676986/60‑1 (MQ=255) gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCg  <  1:278856/60‑1 (MQ=255) gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCg  <  1:1048653/60‑1 (MQ=255) gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCg  <  1:322725/60‑1 (MQ=255) gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCg  <  1:364533/60‑1 (MQ=255) gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCg  <  1:410108/60‑1 (MQ=255) gCTGGTTTTTCTCCGCCAGTGTCTGAACCTGACTGGCTGCCCGCGCCACGTCATTCACCg  <  1:442160/60‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑