Missing coverage evidence...
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GACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATCGC  >  minE/1415242‑1415303                                                              | gACCCTATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:810352/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1747832/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:998324/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:889844/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:714330/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:669234/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:332740/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1852098/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1841238/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1820339/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1003459/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1558429/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1537528/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1499604/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1418154/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1403249/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1351797/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1236253/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:106885/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1009380/62‑1 (MQ=255) gACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTATGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1189176/62‑1 (MQ=255)  aCCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1645549/61‑1 (MQ=255)  aCCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:207635/61‑1 (MQ=255)  aCCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:352206/61‑1 (MQ=255)  aCCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGAAATGAATcgc  <  1:978404/61‑1 (MQ=255)     cGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATcgc  <  1:1303011/58‑1 (MQ=255)                                                              | GACCCGATGCAGTTCTGCCACCATCTCAACGACGGTTTCTGTCGGTTCCAGCAATGAATCGC  >  minE/1415242‑1415303

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑