Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1428444	1428592	149	99 [0]	[0] 34	napA	nitrate reductase, periplasmic, large subunit

GACCGTGACCGCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGCCC  >  minE/1428382‑1428443                                                              | gaccgttaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1618138/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1865872/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:508577/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:496387/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:488906/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:46050/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:400344/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:367969/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:304494/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:235790/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:23140/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:211721/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:210651/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:197854/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:54331/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1845122/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1823145/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1812640/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1804515/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1778386/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1773244/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1761093/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1741070/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1689722/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:10524/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:730748/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:999265/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:998162/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:972704/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:957379/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:955095/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:94336/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:91521/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:84640/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:841094/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:820401/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:770599/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1657610/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:723053/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:721507/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:714743/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:690756/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:684287/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:6829/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:655586/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:584516/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:583283/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:578116/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:551318/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1228567/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1329785/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1655948/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1319554/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1308422/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:130722/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1284798/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1267871/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1265296/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1242744/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1239757/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1239737/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1326866/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1206698/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1198553/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1192562/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1171678/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1140853/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1123948/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1115405/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1093782/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1063957/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:106020/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1058198/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1522396/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1634600/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1629640/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1618171/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1611412/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1596353/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1586342/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1570161/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1567471/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1541210/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1360245/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:152141/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1517019/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1509065/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1502687/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1499579/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1478213/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1477715/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1472181/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1463114/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1434276/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1398410/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCACTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:808759/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACCAAACCATGCATACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:1618220/1‑62 (MQ=255) gaccgtgaccgCGACAAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:66956/1‑62 (MQ=255) gaccgcgaccgcGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGccc  >  1:847189/1‑62 (MQ=255)                                                              | GACCGTGACCGCGACCAAACCATGCGTACTCTTCGAACAGCCCTTTTTGCAGATAGAAGCCC  >  minE/1428382‑1428443

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑