Missing coverage evidence...
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CCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTT  >  minE/126564‑126625                                                              | ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGCTCCCGGATGAGtt  >  1:78943/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1606555/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:893583/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:694898/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:669417/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:617322/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:531766/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:252190/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1853688/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1849833/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1844766/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1643047/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1025669/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1575982/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1557113/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1541824/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1511879/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1471161/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1442338/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1439796/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1316238/1‑62 (MQ=255) ccgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1298470/1‑62 (MQ=255)  cgtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGtt  >  1:1133159/1‑61 (MQ=255)                                                              | CCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTT  >  minE/126564‑126625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑