Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1501251 1501320 70 40 [0] [0] 3 nuoA/lrhA NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit A/DNA‑binding transcriptional repressor

GTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGTTT  >  minE/1501190‑1501250
                                                            |
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:655841/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:288112/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:293773/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:294990/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:298643/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:369412/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:50887/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:544510/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:577176/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:627578/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1046967/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:694658/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:723244/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:741659/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:802022/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:818430/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:831458/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:887541/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:966176/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1045924/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:107836/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:116155/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1195563/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1205254/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1230684/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1324747/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1395706/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1509967/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1528248/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1677626/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1678366/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1680572/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:179058/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1819004/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1826905/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1850951/61‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:23010/61‑1 (MQ=255)
 ttttttTCTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:555690/60‑1 (MQ=255)
 ttttttACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:265390/60‑1 (MQ=255)
  tttttACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGttt  <  1:1542064/59‑1 (MQ=255)
                                                            |
GTTTTTTACTCCTTTCTATAACCTTTTGTCAACTTTAACAAAAGTTTCTTCACATTAGTTT  >  minE/1501190‑1501250

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: