Missing coverage evidence...
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ATGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAGG  >  minE/1518047‑1518102                                                        | aTGGTGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:506364/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:408664/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:556451/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:549420/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:518657/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:506939/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:504289/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:492651/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:463159/1‑56 (MQ=255) aTGGCGCTGGTTTCAGGACGCCAAGACGCGCCGCGACCAGGCTCACGCGCTCAAgg  >  1:455554/1‑56 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑