Missing coverage evidence...
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TGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCG  >  minE/1528490‑1528548                                                           | tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCTCGCCACAAAATCCGGCg  <  1:918253/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:353130/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:993888/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:885175/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:854336/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:795943/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:742149/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:662679/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:647711/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:624154/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:6170/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:410127/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:379965/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1006133/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:302836/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:284195/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1876472/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1591284/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1583528/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1554183/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1358666/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1268266/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1204644/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1164062/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1057597/59‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCg  <  1:1044348/59‑1 (MQ=255)                                                           | TGGCAGAGCTGAAGCAGGTGCTGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCG  >  minE/1528490‑1528548

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑