Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1539828	1539926	99	50 [0]	[0] 11	yfcU	predicted export usher protein

GAAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTAA  >  minE/1539766‑1539827                                                              | gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:582428/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1785492/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1817480/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:186744/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1897696/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:190167/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:235309/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:376018/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:379499/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:446772/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:447165/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:525542/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:527131/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1062610/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:591103/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:599261/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:683903/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:695732/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:761133/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:774526/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:786634/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:793924/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:818583/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:895989/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:91007/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1418953/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1006301/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1102660/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1138243/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1234082/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1273256/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1305788/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1310257/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1317824/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1348301/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1351772/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:137547/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1430430/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1463208/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1466204/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1510917/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1511310/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1516901/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1594813/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1651843/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1693370/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1700570/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:174787/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTAGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1203269/1‑62 (MQ=255) gaAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATCCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTaa  >  1:1753831/1‑62 (MQ=255)                                                              | GAAGGTGGATCCCAGTCGGGCCAGGTATATTCGAGGTAAGCCTGCGGTAGTGAAATGACTAA  >  minE/1539766‑1539827

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑