Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1549527 1550071 545 110 [0] [0] 21 vacJ predicted lipoprotein

Only 100 of 110 total aligned reads displayed.

AAAAAGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTA  >  minE/1549464‑1549526
                                                              |
aaaaaGGTGAG‑TTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:264181/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:233496/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:412110/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:385311/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:367526/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:356363/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:342195/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:334791/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:312646/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:285691/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:256742/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:246412/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:41366/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:21775/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:21277/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1816611/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:18162/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1815541/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:175075/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:172218/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1720062/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1604967/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1557343/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:717824/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:943233/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:939770/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:911614/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:903124/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:825812/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:817682/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:792967/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:786574/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:769644/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:736816/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:726761/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1689189/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:716338/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:666322/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:626766/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:616277/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:58302/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:566399/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:527681/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:520755/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:474541/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:450282/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1188393/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1269052/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1252043/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1250052/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1247158/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1246376/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1246341/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1235717/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1223483/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1219600/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:119954/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1197350/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1249816/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1170486/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1141147/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1109832/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1101381/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:109481/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1058218/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1056911/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1054020/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1021004/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1020955/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1285129/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1529751/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1468041/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1457076/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1453694/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1443596/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:144065/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1414691/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1278213/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1333330/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1404331/62‑1 (MQ=255)
 aaaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1357446/62‑1 (MQ=255)
  aaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1791171/61‑1 (MQ=255)
  aaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1534392/61‑1 (MQ=255)
  aaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1488651/61‑1 (MQ=255)
  aaaGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1429574/61‑1 (MQ=255)
    aGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1072650/59‑1 (MQ=255)
       tGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1384609/56‑1 (MQ=255)
        gAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1387740/55‑1 (MQ=255)
        gAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1021950/55‑1 (MQ=255)
         aGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:152263/54‑1 (MQ=255)
          gTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:114835/53‑1 (MQ=255)
           ttttGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1533904/52‑1 (MQ=255)
           ttttGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:833439/52‑1 (MQ=255)
            tttGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1174265/51‑1 (MQ=255)
            tttGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1458512/51‑1 (MQ=255)
            tttGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1010437/51‑1 (MQ=255)
                cGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:1779806/47‑1 (MQ=255)
                 gACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:539573/46‑1 (MQ=255)
                   cTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTa  <  1:569728/44‑1 (MQ=255)
                    tCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGTATCAATATCTTTTa  <  1:1813998/43‑1 (MQ=255)
                                                              |
AAAAAGGTGAGTTTTGCGACTCACCTTTTTTATTTGTTTCTTATTCAGAATCAATATCTTTTA  >  minE/1549464‑1549526

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑