Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1557552 1557555 4 131 [0] [0] 37 emrY predicted multidrug efflux system

Only 100 of 131 total aligned reads displayed.

GACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAT  >  minE/1557510‑1557551
                                         |
gACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1138870/42‑1 (MQ=255)
 aCAGCGATAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1000620/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:502964/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:519287/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:499183/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:493093/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:479235/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:470000/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:459781/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:432877/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:384493/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:374496/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:373488/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:346900/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:337107/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:325054/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:277397/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:276881/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:266616/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:248890/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:248715/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:238722/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:220970/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:202422/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1870164/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1842978/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:774414/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:983182/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:983178/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:978356/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:968926/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:941339/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:941024/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:939851/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:922343/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:905166/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:863771/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:817023/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1833443/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:73166/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:703141/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:695551/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:675450/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:670164/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:64468/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:625315/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:614123/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:603141/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:591902/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:543013/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1183460/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1348690/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1336781/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1331038/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:131330/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1310597/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1300217/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:128006/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1275714/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:124933/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1197059/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1192165/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1186684/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1768010/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:117430/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1140218/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:112592/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1124085/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1122888/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1094000/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1090793/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1057067/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:102570/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1023919/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:10033/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1377506/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1830588/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1763601/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1742753/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1722469/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:171496/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1708181/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1665507/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:165817/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1646974/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1644285/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1628270/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1592291/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:157259/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1560848/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1541322/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1527316/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1522504/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1488045/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1411564/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1404608/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1387497/41‑1 (MQ=255)
 aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAAACTTAAt  <  1:339770/41‑1 (MQ=255)
  cAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:1749079/40‑1 (MQ=255)
  cAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAt  <  1:517592/40‑1 (MQ=255)
                                         |
GACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAT  >  minE/1557510‑1557551

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑