Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1562439	1562645	207	23 [0]	[0] 52	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

CTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACG  >  minE/1562377‑1562438                                                              | cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATTGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:358021/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCTATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1772672/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1839753/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:868959/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:816242/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:766972/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:678758/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:482780/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:458175/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:359388/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:331624/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:299688/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1372940/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1809641/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1684842/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1608981/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1530465/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1510725/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1507200/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1458887/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1436941/62‑1 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGCGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:1755595/62‑1 (MQ=255)  ttGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg  <  1:837118/61‑1 (MQ=255)                                                              | CTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACG  >  minE/1562377‑1562438

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑