Missing coverage evidence...
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GCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAAGAG  >  minE/1575708‑1575769                                                              | gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATATAAGCAGCTCTGAagag  <  1:597835/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAatag  <  1:1351280/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:1140573/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:1488303/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:1515604/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:1619114/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:1672672/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:1753362/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:217495/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:331950/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:63377/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:724414/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:860507/62‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:90064/62‑1 (MQ=255)   cGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:758751/60‑1 (MQ=255)            ataaaataTCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAagag  <  1:269488/51‑1 (MQ=255)                                                              | GCCGGAAGAAAATAAAATATCTTTCACTAATTAACCTTTATCATAAAAGCAGCTCTGAAGAG  >  minE/1575708‑1575769

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑