Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1634336 1634618 283 126 [0] [0] 185 acrD aminoglycoside/multidrug efflux system

Only 100 of 126 total aligned reads displayed.

CTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGT  >  minE/1634274‑1634335
                                                             |
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATTGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:249261/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:31667/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:513039/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:501939/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:495330/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:494237/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:480466/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:463260/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:416089/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:415369/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:401699/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:384482/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:371116/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:364805/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:514248/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:313477/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:27044/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:2599/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:250680/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:243274/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:236105/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1856841/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1851246/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1839579/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1030880/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:758092/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:94566/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:937408/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:927247/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:908494/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:903746/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:896937/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:867604/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:84207/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:832345/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:817476/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:81584/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:759580/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1821837/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:743748/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:725854/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:701802/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:675177/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:648142/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:647512/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:633077/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:601128/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:593834/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:586570/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:533011/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1287787/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:14802/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1436679/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1418303/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1395523/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1390753/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1365467/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1330316/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1315686/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1297917/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1295854/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1768564/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1273337/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1267234/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:123571/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1235698/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1230928/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1229025/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1154569/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:105341/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1048541/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1031066/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1667725/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1789611/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1758971/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1736251/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1733559/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1725580/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1724547/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1703484/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1701149/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1492947/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1652078/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:163995/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1611415/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1605114/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:157609/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1566174/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1562627/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1560083/62‑1 (MQ=255)
cTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1536391/62‑1 (MQ=255)
 tGACCATTGCCTTCTTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGTATATTGCTGATTATGt  <  1:1138562/61‑1 (MQ=255)
 tGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:381791/61‑1 (MQ=255)
 tGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:170918/61‑1 (MQ=255)
 tGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1434536/61‑1 (MQ=255)
  gACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:109086/60‑1 (MQ=255)
         gCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1298077/53‑1 (MQ=255)
               gTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1189875/47‑1 (MQ=255)
                         aTGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1502612/37‑1 (MQ=255)
                           ggTTCGATTGATAAACAGGATATTGCTGATTATGt  <  1:1270169/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
CTGACCATTGCCTTCGTCTCTACCGATGGTTCGATGGATAAACAGGATATTGCTGATTATGT  >  minE/1634274‑1634335

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑