Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1634859 1635467 609 132 [0] [0] 23 acrD aminoglycoside/multidrug efflux system

Only 100 of 132 total aligned reads displayed.

AGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGTTT  >  minE/1634797‑1634858
                                                             |
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGTACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:264926/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:355209/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:640003/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:639851/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:621678/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:574937/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:557053/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:497309/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:49225/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:490091/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:411679/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:409362/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:373094/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:36487/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:66938/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:34666/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:319539/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:311317/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:30375/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:261852/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:253245/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:234946/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:227586/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:199181/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1043872/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:86251/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:990733/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:985328/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:972659/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:952301/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:946741/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:93628/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:925857/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:91637/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:910951/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:888948/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:873966/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:868991/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1872216/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:838209/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:812096/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:804038/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:803516/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:75309/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:711902/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:706820/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:700024/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:679412/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:674940/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:674723/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1241732/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1853046/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1443069/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1415673/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:141407/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:139862/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:13653/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1333405/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1329744/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1304380/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1287052/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:126073/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1249868/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1445052/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1228680/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1221689/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1179246/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1159396/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:115816/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1102387/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1090481/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1079927/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1075304/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1075228/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1065121/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1610719/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1814511/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1795154/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1768375/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1765339/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1742031/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1724427/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1723633/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1705126/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1697099/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1671859/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:162363/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1610801/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:145810/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1606286/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1586787/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:158270/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1582315/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1545525/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:153860/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1524106/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1480244/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGttt  >  1:1461031/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGatt  >  1:1388995/1‑62 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTAAGAAACCACCTCGttt  >  1:570985/1‑62 (MQ=255)
                                                             |
AGCTGGCGCAGTATTTCCCGCATGGACTGGAATACAAGGTGGCGTATGAAACCACCTCGTTT  >  minE/1634797‑1634858

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑