Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1646546	1646592	47	42 [0]	[0] 10	gcvR	DNA‑binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA

CTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCG  >  minE/1646485‑1646545                                                             | cTCCCCTCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1265666/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGCCGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:404897/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:457468/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1812679/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1818168/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:184235/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:244856/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:2567/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:258955/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:263106/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:312479/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:444562/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1810034/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:473512/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:489502/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:620888/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:682334/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:722808/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:759506/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:77876/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:910848/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1395205/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1048857/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1083205/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:108337/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1100566/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1126519/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1168797/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1281301/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1282213/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:138448/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:104312/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:142935/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1429808/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1432854/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1439452/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:16480/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:175530/61‑1 (MQ=255) cTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1801631/61‑1 (MQ=255)          tttAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:65562/52‑1 (MQ=255)                 gAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:1657932/45‑1 (MQ=255)                  aaCGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCg  <  1:178858/44‑1 (MQ=255)                                                             | CTCCCCGCATTTAATTGAACGCTTCACAGCACTTTTCGACGCGCATCATATGAACATTGCG  >  minE/1646485‑1646545

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑