Missing coverage evidence...
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GCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCACT  >  minE/1691541‑1691603                                                             |   gcacAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:615754/4‑61 (MQ=255) gCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGCCGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:363823/1‑61 (MQ=255) gCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:431309/1‑61 (MQ=255) gCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:555576/1‑61 (MQ=255) gCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:529172/1‑61 (MQ=255) gCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:520140/1‑61 (MQ=255) gCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:501063/1‑61 (MQ=255) gCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:468295/1‑61 (MQ=255) gCCCAGGTCAATACCGGCCGCCAGACGACGCTGATGCGGCGCAGCACTCAAACCAGGTTCa    >  1:445196/1‑61 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑