Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1701218	1701474	257	17 [0]	[0] 28	hcaR	DNA‑binding transcriptional regulator

CACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGC  >  minE/1701168‑1701217                                                  | caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1155997/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1361774/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1398780/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1400912/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1420344/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1443211/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1617809/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1829218/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:521945/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:20402/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:424653/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:348298/50‑1 (MQ=255) caccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:357733/50‑1 (MQ=255)  accacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:837845/49‑1 (MQ=255)  accacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1866506/49‑1 (MQ=255)   ccacGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:292377/48‑1 (MQ=255)           aaTTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGc  <  1:1182235/40‑1 (MQ=255)                                                  | CACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGC  >  minE/1701168‑1701217

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑