Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1715551	1715570	20	41 [0]	[0] 126	yphH	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

CAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAT  >  minE/1715490‑1715550                                                             | cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATGATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:471521/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:522113/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1779705/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1809400/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:184381/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1852140/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1864268/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1885164/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:263214/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:333959/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:437359/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1722097/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:580118/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:618586/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:783617/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:857563/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:869030/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:894172/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:905343/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:912710/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:946863/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1277884/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1067760/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1115511/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1126905/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1128964/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1176432/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1233262/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1233573/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1247993/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1250148/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1052569/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1322507/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1384712/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1429795/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1433681/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1494072/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1609988/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1716902/61‑1 (MQ=255) cAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1720194/61‑1 (MQ=255)       ggCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAt  <  1:1325862/55‑1 (MQ=255)                                                             | CAATCTGGCAATGTTTTCGCGGAATAATCACGCAATTAACTAAACAAGGTTTAGTGAAGAT  >  minE/1715490‑1715550

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑