Missing coverage evidence...
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CCCACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCT  >  minE/1731032‑1731093                                                              | cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:234775/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:980840/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:777201/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:487541/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:446312/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:441708/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:38487/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:345889/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:302821/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:280080/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:265444/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:264837/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1049617/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1868708/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1805689/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1711635/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1670904/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1558231/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1394364/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1339680/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1268818/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1257284/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1173668/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1153603/62‑1 (MQ=255) cccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:1139750/62‑1 (MQ=255)  ccACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:899084/61‑1 (MQ=255)                     ggCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCt  <  1:628053/42‑1 (MQ=255)                                                              | CCCACAGAAGCAGACTCATCGGCCAGCGTGCCGCACGACCTTTTATCAATAACGCAATGGCT  >  minE/1731032‑1731093

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑