Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1742149	1742411	263	53 [0]	[0] 121	rpoE	RNA polymerase, sigma 24 (sigma E) factor

CCGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACTT  >  minE/1742114‑1742148                                   | ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:602562/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:258473/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:290185/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:375257/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:392463/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:393269/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:399280/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:436623/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:454784/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:519843/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:564190/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:59334/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:598872/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:237686/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:649369/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:660738/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:737697/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:743967/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:770581/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:790591/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:83492/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:850474/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:911738/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:924305/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:960047/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:993561/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1434770/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1059631/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1113557/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1115209/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:112396/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1207842/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1209321/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1247109/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1315476/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1326293/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:132713/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1365009/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1392473/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1425090/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:104761/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1448913/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1469822/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1471388/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1506236/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1578753/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1631028/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1651041/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1741386/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1769972/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:1866404/35‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:216871/35‑1 (MQ=255) ccGCTATAGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACtt  <  1:507293/35‑1 (MQ=255)                                   | CCGCTATCGTCAACGCCTGATAAGCGGTTGAACTT  >  minE/1742114‑1742148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑